Linhas de Pesquisa

Bioinformática Genômica (montagem, anotação e comparação de genomas e transcriptomas; análise de repetições e elementos transponíveis; análises filogenéticas; análise de variantes e marcadores moleculares; descoberta e caracterização de genes, promotores e reguladores); Desenvolvimento de sistemas e processamento de dados para bioinformática (pipelines de análise; sistemas web; manipulação de dados biológicos massivos através de programação computacional).

 

Estrutura e equipamentos

50 m2 em dois ambientes separados. Na Sala de Apoio, para usuários avançados, estão seis desktops, e no Laboratório principal (37 m2), para bioinformatas e desenvolvedores, estão atualmente cinco estações de trabalho móveis de alto desempenho, com dois monitores (HP EliteBook Folio 1040 G1), mais um desktop de parceiro. Todos com acesso aos servidores do LBB, organizados em rack próprio no CPD da unidade. No rack, estão instalados cinco servidores, sendo três (HP ProLiant DL785 G5, HP ProLiant DL585 G7 e Dell PowerEdge R930) utilizados diretamente em análises de bioinformática, e dois (HP ProLiant DL380 G5 e HP ProLiant DL380 G7) como base para diferentes Máquinas Virtuais (PostgreSQL, MySQL, Bacula, Servidor web, Zabbix, Servidor de arquivos, Proxy reverso, GitLab). Ainda no rack, dois storages (HP StorageWorks MSA60 e HP P2000 G3 MSA Array System), um sistema de backup em fitas (IBM System Storage TS 3100 Tape Backup LTO-3) e um KVM para conexão local com os equipamentos.