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Reúne os projetos de pesquisa básica e/ou aplicada ligados a solo, água, manejo e conservação, manejo integrado de pragas/controle biológico, biotecnologia de solo, estudos de impacto ambiental e sócio-econômico, estudo sobre aproveitamento de resíduos, projetos que busquem a preservação e otimização de recursos naturais (água, solo, inimigos naturais, coberturas vegetais, plantas infestantes), estudos de alelopatia, bioherbicidas, bio-inseticidas e biofungicidas; também compõem esse núcleo os estudos de cenários futuros climáticos, econômicos e sociais.