II Oficina de Bioinformática

Local

Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Brasília-DF

Data de realização

De 15 a 17 de Julho de 2015.

Período de inscrições

Até 13 de Julho de 2015

Documentos

Edital de abertura do curso
(arquivo PDF, 1,04MB, 24/06/2015)

Formulário para inscrição
 


O Laboratório de Bioinformática (LBI) da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia oferece a II Oficina de Bioinformática que se realizará nos dias 15, 16 e 17 de julho de 2015, das 9h às 17h no auditório Central. Número de vagas: 35.

Os interessados devem se inscrever através do formulário online até o dia 13/07/2015. A confirmação será via e-mail. É desejável, mas não obrigatório, que cada participante leve o seu laptop para o desenvolvimento de algumas práticas.

Segue abaixo a programação da oficina (que podem sofrer mudanças sem aviso prévio):

OBS: Havendo mais inscrições do que o número de vagas, a seleção será pelo perfil do candidato.

15/07/2015, quarta-feira

09:00 - 09:30
Abertura e retrospectiva da I Oficina de Bioinformática
Priscila Grynberg

09:30 - 10:20
Tecnologias de sequenciamento de nova geração: conceitos e desenho experimental
Priscila Grynberg

10:20 - 10:30 – Intervalo

10:30 - 11:00
Tecnologias de sequenciamento de nova geração: procedimentos de tratamento de dados e montagem
Marcos Mota

11:00 - 12:00
Tópico especial: Utilização do Mendeley e Google docs: utilizando o Mendeley para organização de artigos científicos e como trabalhar colaborativamente com o Google docs (escrita de papers, projetos, etc)    Natália Martins e Roberto Togawa

12:00 - 14:00 – Almoço

14:00 - 17:00
Prática: Utilização do Mendeley e instalaçáo dos programas a serem utilizados durante a oficina
Natália Martins, Ana Zotta, Gabriel Alves e Emmanuel Bresso

16/07/2015, quinta-feira

09:00 - 10:30
Uso da plataforma Galaxy para tratamento de dados de NGS
Roberto Togawa e Gabriel Alves

10:30 - 10:40 – Intervalo

10:40 - 12:00
Análise Funcional de dados: ontologia gênica e interaçães (Cytoscape/String)
Priscila Grynberg e Ana Zotta

12:00 - 14:00 – Almoço

14:00 - 17:00
Prática: Galaxy, Blast2GO, Cytoscape + String
Gabriel Alves e Ana Zotta

17/07/2015, sexta-feira

09:00 - 09:45
Introdução a Bioinformática Estrutural    Natália Martins

09:45 - 10:20
Visualizadores de estruturas de proteínas    Emmanuel Bresso

10:20 - 10:30 – Intervalo

10:30 - 11:00
Docking de proteínas    Natália Martins

11:00 - 12:00
Plataformas Integrativas de dados (Drupal/Tripal e MusaHub)    Natália Martins, Roberto Togawa e Gabriel Alves

12:00 - 14:00 – Almoço

14:00 - 17:00
Prática: VMD, docking e MusaHub
Emmanuel Bresso e Ana Zotta