Projetos

Desenvolvimento de metodologias para análises genômicas provenientes do sequenciamento de nova geração e formação de recursos humanos para atuar em áreas estratégicas do agronegócio brasileiro

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Este projeto tem como propostas desenvolver novos métodos computacionais em bioinformática por meio de workflows (gerenciamento de processos utilizados em experimentos científicos) para serem aplicados em análises de dados genômicos e capacitar pesquisadores brasileiros para análise de grandes conjuntos de sequências de DNA e RNA envolvidas nas áreas "ômicas" (genômica, transcriptômica, exômica, metagenômica e metatranscriptômica). As atividades vão ser desenvolvidas por uma equipe multidisciplinar e multi-institucional, envolvendo unidades da Embrapa, Esalq/USP, Unesp de Araçatuba e Universidade de Idaho (EUA).
Os dados utilizados neste projeto serão provenientes de outros projetos em andamento como, por exemplo, o projeto “Identificação de genes associados a problemas locomotores em frango de corte por meio de RNA-seq do fêmur” (01.11.07.002.04.03) que visa identificar genes associados ao controle genético de características ligadas à integridade óssea na galinha por meio do sequenciamento do RNA mensageiro do fêmur e da tíbia.
Serão identificados genes candidatos funcionais expressos nos animais com problemas de integridade óssea, nos quais poderão ser identificados marcadores com potencial uso na avaliação genética para redução desses problemas. Além disso, possíveis rotas metabólicas no tecido ósseo poderão ser exploradas.
Projeto: Identificação de genes associados a problemas locomotores em frango de corte por meio de RNA-seq do fêmur (01.11.07.002.04.03)

Responsável: Jane de Oliveira Peixoto
Unidade líder: Embrapa Suínos e Aves
Contato: jane.peixoto@embrapa.br
Situação: Concluído (Data de Início: 05/2013 | Data Término: 12/2018)
Palavras-chave: transcriptoma, necrose, tíbia, fêmur, aves

Ecossistema: Extremo Sul

Região: Sul

Situação: concluído Data de Início: 03/2014 Data de Finalização: 02/2017

Unidade Lider: Embrapa Suínos e Aves

Líder do Projeto: Mônica Corrêa Ledur

Contato: monica.ledur@embrapa.br